MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 62970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021081	CAG	2	6	149420	149425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881799
3002	NC_021081	GCT	2	6	149509	149514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881799
3003	NC_021081	TGG	2	6	149535	149540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881799
3004	NC_021081	GCA	2	6	149587	149592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881799
3005	NC_021081	GCC	2	6	149656	149661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881799
3006	NC_021081	ACCCC	2	10	149719	149728	20 %	0 %	0 %	80 %	482881799
3007	NC_021081	GGC	2	6	149729	149734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881799
3008	NC_021081	CAGC	2	8	149746	149753	25 %	0 %	25 %	50 %	482881799
3009	NC_021081	CGG	2	6	149824	149829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881799
3010	NC_021081	CTC	2	6	149992	149997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881800
3011	NC_021081	GGC	3	9	150049	150057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881800
3012	NC_021081	GCTGCG	2	12	150097	150108	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	482881800
3013	NC_021081	CAA	2	6	150133	150138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881800
3014	NC_021081	TGG	2	6	150171	150176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881800
3015	NC_021081	GAT	2	6	150181	150186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881800
3016	NC_021081	AAC	2	6	150212	150217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881800
3017	NC_021081	CCA	2	6	150222	150227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881800
3018	NC_021081	CAT	2	6	150325	150330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881800
3019	NC_021081	GCA	3	9	150336	150344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881800
3020	NC_021081	GAA	2	6	150346	150351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881800
3021	NC_021081	AGGCC	2	10	150354	150363	20 %	0 %	40 %	40 %	482881800
3022	NC_021081	AGG	2	6	150365	150370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881800
3023	NC_021081	CCG	2	6	150389	150394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881800
3024	NC_021081	GAA	2	6	150421	150426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881800
3025	NC_021081	CAG	2	6	150430	150435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881800
3026	NC_021081	GCA	2	6	150483	150488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881800
3027	NC_021081	GCG	2	6	150712	150717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881800
3028	NC_021081	GGTC	2	8	150723	150730	0 %	25 %	50 %	25 %	482881800
3029	NC_021081	CCTGGG	2	12	150744	150755	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	482881800
3030	NC_021081	CAG	2	6	150760	150765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881800
3031	NC_021081	CAG	2	6	150781	150786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881800
3032	NC_021081	GTC	2	6	150799	150804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881800
3033	NC_021081	GGC	2	6	150855	150860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881800
3034	NC_021081	GCC	2	6	150920	150925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881800
3035	NC_021081	CGGG	2	8	150934	150941	0 %	0 %	75 %	25 %	482881800
3036	NC_021081	G	7	7	150980	150986	0 %	0 %	100 %	0 %	482881800
3037	NC_021081	G	6	6	150990	150995	0 %	0 %	100 %	0 %	482881800
3038	NC_021081	C	7	7	151008	151014	0 %	0 %	0 %	100 %	482881800
3039	NC_021081	G	7	7	151022	151028	0 %	0 %	100 %	0 %	482881800
3040	NC_021081	GTG	4	12	151034	151045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881800
3041	NC_021081	CGC	2	6	151055	151060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881800
3042	NC_021081	ACC	2	6	151135	151140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881800
3043	NC_021081	CGCGGG	2	12	151197	151208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881800
3044	NC_021081	CGCAC	2	10	151265	151274	20 %	0 %	20 %	60 %	482881800
3045	NC_021081	CTGGGC	2	12	151279	151290	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	482881800
3046	NC_021081	CAAA	2	8	151332	151339	75 %	0 %	0 %	25 %	482881800
3047	NC_021081	GTT	2	6	151357	151362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881800
3048	NC_021081	CGG	2	6	151365	151370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881800
3049	NC_021081	GCA	2	6	151431	151436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881800
3050	NC_021081	TGA	2	6	151515	151520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881800
3051	NC_021081	GCT	2	6	151546	151551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881800
3052	NC_021081	GCG	2	6	151552	151557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881800
3053	NC_021081	GGCG	2	8	151569	151576	0 %	0 %	75 %	25 %	482881800
3054	NC_021081	CTG	2	6	151588	151593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881800
3055	NC_021081	GCA	2	6	151605	151610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881800
3056	NC_021081	CAGGC	2	10	151760	151769	20 %	0 %	40 %	40 %	482881800
3057	NC_021081	CCT	2	6	151812	151817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881801
3058	NC_021081	GCA	2	6	151929	151934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881801
3059	NC_021081	CAC	2	6	152077	152082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881801
3060	NC_021081	CCT	2	6	152094	152099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881801
3061	NC_021081	GGCGCT	2	12	152121	152132	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	482881801
3062	NC_021081	CTGG	2	8	152196	152203	0 %	25 %	50 %	25 %	482881801
3063	NC_021081	GCT	2	6	152226	152231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881801
3064	NC_021081	TC	3	6	152277	152282	0 %	50 %	0 %	50 %	482881801
3065	NC_021081	C	7	7	152353	152359	0 %	0 %	0 %	100 %	482881801
3066	NC_021081	GCT	2	6	152377	152382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881801
3067	NC_021081	ACC	2	6	152399	152404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881801
3068	NC_021081	GAT	2	6	152419	152424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881801
3069	NC_021081	T	6	6	152424	152429	0 %	100 %	0 %	0 %	482881801
3070	NC_021081	CCCA	2	8	152854	152861	25 %	0 %	0 %	75 %	482881802
3071	NC_021081	GCG	2	6	152942	152947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881802
3072	NC_021081	GGC	2	6	152953	152958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881802
3073	NC_021081	T	6	6	153020	153025	0 %	100 %	0 %	0 %	482881802
3074	NC_021081	GCC	2	6	153057	153062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881802
3075	NC_021081	TGT	2	6	153117	153122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881802
3076	NC_021081	GCT	2	6	153161	153166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881802
3077	NC_021081	TGC	2	6	153168	153173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881802
3078	NC_021081	GGT	2	6	153190	153195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881802
3079	NC_021081	ACTG	2	8	153244	153251	25 %	25 %	25 %	25 %	482881802
3080	NC_021081	TGGGG	2	10	153277	153286	0 %	20 %	80 %	0 %	482881802
3081	NC_021081	TGG	2	6	153309	153314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881802
3082	NC_021081	GGCTG	2	10	153315	153324	0 %	20 %	60 %	20 %	482881802
3083	NC_021081	TGG	2	6	153351	153356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881802
3084	NC_021081	GCG	2	6	153365	153370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881802
3085	NC_021081	TGT	2	6	153375	153380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881802
3086	NC_021081	CGG	2	6	153390	153395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881802
3087	NC_021081	GCT	2	6	153439	153444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881802
3088	NC_021081	GCT	2	6	153454	153459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881802
3089	NC_021081	TGG	2	6	153489	153494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881802
3090	NC_021081	TGGG	2	8	153545	153552	0 %	25 %	75 %	0 %	482881802
3091	NC_021081	TGC	2	6	153555	153560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881802
3092	NC_021081	GCC	2	6	153617	153622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881802
3093	NC_021081	TGG	2	6	153639	153644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881802
3094	NC_021081	TGG	3	9	153666	153674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881802
3095	NC_021081	TGG	2	6	153714	153719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881802
3096	NC_021081	GCG	3	9	153806	153814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881802
3097	NC_021081	GCA	2	6	153819	153824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881802
3098	NC_021081	CGG	2	6	153834	153839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881802
3099	NC_021081	TGG	3	9	153885	153893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881802
3100	NC_021081	ACCT	2	8	153911	153918	25 %	25 %	0 %	50 %	482881802
3101	NC_021081	GGA	2	6	153924	153929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881802
3102	NC_021081	ACCG	2	8	153981	153988	25 %	0 %	25 %	50 %	482881803
3103	NC_021081	ACC	2	6	154042	154047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881803
3104	NC_021081	GCG	2	6	154069	154074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881803
3105	NC_021081	CTG	2	6	154101	154106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881803
3106	NC_021081	CCA	2	6	154174	154179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881803
3107	NC_021081	GGGC	2	8	154239	154246	0 %	0 %	75 %	25 %	482881803
3108	NC_021081	ACCCG	2	10	154349	154358	20 %	0 %	20 %	60 %	482881803
3109	NC_021081	C	6	6	154396	154401	0 %	0 %	0 %	100 %	482881803
3110	NC_021081	AGG	2	6	154402	154407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881803
3111	NC_021081	CGG	2	6	154444	154449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881803
3112	NC_021081	GGCC	2	8	154454	154461	0 %	0 %	50 %	50 %	482881803
3113	NC_021081	CAC	2	6	154478	154483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881803
3114	NC_021081	CCAC	2	8	154487	154494	25 %	0 %	0 %	75 %	482881803
3115	NC_021081	TAG	2	6	154660	154665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881804
3116	NC_021081	CAG	2	6	154773	154778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881804
3117	NC_021081	CA	3	6	154781	154786	50 %	0 %	0 %	50 %	482881804
3118	NC_021081	GCT	2	6	154818	154823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881804
3119	NC_021081	CAG	2	6	154836	154841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881804
3120	NC_021081	CAC	2	6	154866	154871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881804
3121	NC_021081	CTG	2	6	154884	154889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881804
3122	NC_021081	C	6	6	154900	154905	0 %	0 %	0 %	100 %	482881804
3123	NC_021081	GCC	2	6	154951	154956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881804
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3126	NC_021081	C	7	7	155001	155007	0 %	0 %	0 %	100 %	482881804
3127	NC_021081	GGGC	2	8	155013	155020	0 %	0 %	75 %	25 %	482881804
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3135	NC_021081	CGG	2	6	155238	155243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881805
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3241	NC_021081	GGC	2	6	159725	159730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881810
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3244	NC_021081	CTT	2	6	159829	159834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881810
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3271	NC_021081	ATC	2	6	161274	161279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881812
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3356	NC_021081	TGAA	2	8	165541	165548	50 %	25 %	25 %	0 %	482881817
3357	NC_021081	CGA	2	6	165581	165586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881817
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3360	NC_021081	C	7	7	165639	165645	0 %	0 %	0 %	100 %	482881817
3361	NC_021081	TGG	2	6	165722	165727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881817
3362	NC_021081	CGG	2	6	165740	165745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881817
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3486	NC_021081	CGT	2	6	172137	172142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881825
3487	NC_021081	GAA	2	6	172162	172167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881825
3488	NC_021081	CCGA	2	8	172199	172206	25 %	0 %	25 %	50 %	482881825
3489	NC_021081	GGC	2	6	172246	172251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881825
3490	NC_021081	AGC	2	6	172259	172264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881825
3491	NC_021081	CCAG	2	8	172350	172357	25 %	0 %	25 %	50 %	482881825
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3497	NC_021081	GGC	2	6	172771	172776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881825
3498	NC_021081	GAT	2	6	172792	172797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881825
3499	NC_021081	GTT	2	6	172846	172851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881825
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